เครื่องอัดอากาศใช้กันอย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมยา และต่อไปนี้คือการใช้งานหลัก:
อากาศแรงดันสูงที่เกิดจากเครื่องอัดอากาศเป็นสิ่งจําเป็นสําหรับการทํางานที่มั่นคงของอุปกรณ์เภสัชกรรม ตัวอย่างเช่น อากาศแห้งใช้ในการขนส่งวัตถุดิบยา และใช้อากาศอัดเพื่อผลักอุปกรณ์ยาเพื่อให้แน่ใจว่าอุปกรณ์ทํางานได้อย่างมีประสิทธิภาพและเสถียร เนื่องจากมีสิ่งสกปรกหรือความชื้นในอากาศจึงง่ายต่อการลดคุณภาพของยาดังนั้นอากาศอัดบริสุทธิ์คุณภาพสูงที่จัดทําโดยเครื่องอัดอากาศสามารถรักษาความแม่นยําและความเสถียรของยาได้
อากาศอัดของผู้ประกอบการยาส่วนใหญ่จะใช้ในเครื่องบรรจุในการเตรียมของเหลวเครื่องบดย่อยเครื่องปรับขนาดเครื่องบรรจุเครื่องบรรจุเครื่องพิมพ์ในการเตรียมของแข็งและถังสกัดในกระบวนการสกัด นอกจากนี้อากาศอัดยังใช้สําหรับก๊าซทดสอบการขนส่งวัสดุผงการอบแห้งการเป่าและการล้างส่วนประกอบเครื่องมือนิวเมติกก๊าซควบคุมอัตโนมัติ
ในตัวกระตุ้นนิวเมติกข้อกําหนดสําหรับขนาดอนุภาคฝุ่นของแหล่งอากาศโดยทั่วไปคือ ≤1 μm เพื่อให้เป็นไปตามข้อกําหนดนี้โรงงานผลิตยาจําเป็นต้องเลือกอุปกรณ์กรองอากาศที่เหมาะสมเพื่อให้แน่ใจว่าอากาศอัดมีความบริสุทธิ์
โรงงานผลิตยามีข้อกําหนดที่เข้มงวดสําหรับความชื้นของอากาศอัด สําหรับโรงงานผลิตยาที่มีระบบอัตโนมัติในระดับต่ําความดันของอากาศอัดมักจะอยู่ที่ 5 ~ 10 °C โรงงานผลิตยาที่มีเครื่องมือและอุปกรณ์ควบคุมนิวแมติกขนาดใหญ่ต้องการอากาศอัดเพื่อให้มีจุดน้ําค้างแรงดัน -20~-40°C ดังนั้นโรงงานผลิตยาจําเป็นต้องเลือกหน่วยอบแห้งที่เหมาะสมเพื่อให้แน่ใจว่าอากาศอัดแห้ง
โดยทั่วไปการประยุกต์ใช้เครื่องอัดอากาศในอุตสาหกรรมยาเกี่ยวข้องกับทุกด้านของกระบวนการผลิตตั้งแต่การขนส่งวัตถุดิบไปจนถึงการขับเคลื่อนอุปกรณ์ไปจนถึงบรรจุภัณฑ์และการควบคุมคุณภาพของผลิตภัณฑ์ซึ่งทั้งหมดนี้ต้องพึ่งพาเครื่องอัดอากาศเพื่อให้อากาศอัดมีความเสถียรและมีคุณภาพสูง